Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN8Q9UBY8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms