Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTSFQ9UBX1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTSFQ9UBX1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTSFQ9UBX1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTSFQ9UBX1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTSFQ9UBX1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTSFQ9UBX1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTSFQ9UBX1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTSFQ9UBX1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTSFQ9UBX1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTSFQ9UBX1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSFQ9UBX1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms