Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNAL1Q9UBT7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms