Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR2

CTSZ, Cathepsin Z, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSZQ9UBR2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSZQ9UBR2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSZQ9UBR2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSZQ9UBR2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSZQ9UBR2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSZQ9UBR2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSZQ9UBR2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSZQ9UBR2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSZQ9UBR2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSZQ9UBR2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSZQ9UBR2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSZQ9UBR2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSZQ9UBR2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSZQ9UBR2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSZQ9UBR2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSZQ9UBR2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSZQ9UBR2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSZQ9UBR2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSZQ9UBR2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSZQ9UBR2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSZQ9UBR2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSZQ9UBR2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSZQ9UBR2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSZQ9UBR2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSZQ9UBR2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSZQ9UBR2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSZQ9UBR2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSZQ9UBR2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSZQ9UBR2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSZQ9UBR2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSZQ9UBR2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSZQ9UBR2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSZQ9UBR2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSZQ9UBR2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSZQ9UBR2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSZQ9UBR2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSZQ9UBR2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSZQ9UBR2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSZQ9UBR2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSZQ9UBR2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSZQ9UBR2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSZQ9UBR2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSZQ9UBR2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSZQ9UBR2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSZQ9UBR2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms