Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms