Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKD2L1Q9P0L9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKD2L1Q9P0L9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKD2L1Q9P0L9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKD2L1Q9P0L9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKD2L1Q9P0L9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKD2L1Q9P0L9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKD2L1Q9P0L9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKD2L1Q9P0L9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKD2L1Q9P0L9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKD2L1Q9P0L9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKD2L1Q9P0L9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKD2L1Q9P0L9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PKD2L1Q9P0L9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKD2L1Q9P0L9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKD2L1Q9P0L9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKD2L1Q9P0L9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKD2L1Q9P0L9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKD2L1Q9P0L9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKD2L1Q9P0L9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKD2L1Q9P0L9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKD2L1Q9P0L9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKD2L1Q9P0L9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKD2L1Q9P0L9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKD2L1Q9P0L9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKD2L1Q9P0L9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKD2L1Q9P0L9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKD2L1Q9P0L9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKD2L1Q9P0L9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKD2L1Q9P0L9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PKD2L1Q9P0L9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKD2L1Q9P0L9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKD2L1Q9P0L9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKD2L1Q9P0L9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKD2L1Q9P0L9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKD2L1Q9P0L9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKD2L1Q9P0L9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD2L1Q9P0L9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms