Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCMF1Q9P0J7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms