Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD3Q9P035 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD3Q9P035 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD3Q9P035 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD3Q9P035 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD3Q9P035 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD3Q9P035 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD3Q9P035 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD3Q9P035 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD3Q9P035 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HACD3Q9P035 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HACD3Q9P035 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms