Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ3

NCKIPSD, NCK-interacting protein with SH3 domain, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKIPSDQ9NZQ3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCKIPSDQ9NZQ3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms