Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDE1Q9NZC3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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