Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM53CQ9NYF3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM53CQ9NYF3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM53CQ9NYF3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM53CQ9NYF3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM53CQ9NYF3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM53CQ9NYF3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM53CQ9NYF3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM53CQ9NYF3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM53CQ9NYF3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM53CQ9NYF3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM53CQ9NYF3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM53CQ9NYF3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM53CQ9NYF3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM53CQ9NYF3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM53CQ9NYF3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM53CQ9NYF3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM53CQ9NYF3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM53CQ9NYF3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM53CQ9NYF3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM53CQ9NYF3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM53CQ9NYF3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM53CQ9NYF3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM53CQ9NYF3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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FAM53CQ9NYF3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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FAM53CQ9NYF3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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FAM53CQ9NYF3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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FAM53CQ9NYF3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM53CQ9NYF3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
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