Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
GDAP2Q9NXN4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GDAP2Q9NXN4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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