Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms