Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms