Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms