Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
PDS5BQ9NTI5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
PDS5BQ9NTI5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PDS5BQ9NTI5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms