Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOMER2Q9NSB8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOMER2Q9NSB8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOMER2Q9NSB8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOMER2Q9NSB8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOMER2Q9NSB8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOMER2Q9NSB8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOMER2Q9NSB8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOMER2Q9NSB8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOMER2Q9NSB8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOMER2Q9NSB8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOMER2Q9NSB8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOMER2Q9NSB8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOMER2Q9NSB8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOMER2Q9NSB8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOMER2Q9NSB8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOMER2Q9NSB8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOMER2Q9NSB8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOMER2Q9NSB8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOMER2Q9NSB8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOMER2Q9NSB8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOMER2Q9NSB8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOMER2Q9NSB8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOMER2Q9NSB8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOMER2Q9NSB8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOMER2Q9NSB8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOMER2Q9NSB8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOMER2Q9NSB8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOMER2Q9NSB8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOMER2Q9NSB8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOMER2Q9NSB8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOMER2Q9NSB8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOMER2Q9NSB8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOMER2Q9NSB8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOMER2Q9NSB8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOMER2Q9NSB8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOMER2Q9NSB8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOMER2Q9NSB8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOMER2Q9NSB8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOMER2Q9NSB8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOMER2Q9NSB8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOMER2Q9NSB8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOMER2Q9NSB8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOMER2Q9NSB8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms