Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAPOLBQ9NRJ5 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms