Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRH2

SNRK, SNF-related serine/threonine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRKQ9NRH2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRKQ9NRH2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRKQ9NRH2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRKQ9NRH2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRKQ9NRH2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRKQ9NRH2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRKQ9NRH2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRKQ9NRH2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRKQ9NRH2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRKQ9NRH2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRKQ9NRH2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRKQ9NRH2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRKQ9NRH2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRKQ9NRH2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRKQ9NRH2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRKQ9NRH2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRKQ9NRH2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRKQ9NRH2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms