Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
VTA1Q9NP79 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms