Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC8Q9H0W5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms