Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms