Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF3Q9H094 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF3Q9H094 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF3Q9H094 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF3Q9H094 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF3Q9H094 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF3Q9H094 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF3Q9H094 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF3Q9H094 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF3Q9H094 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF3Q9H094 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF3Q9H094 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF3Q9H094 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF3Q9H094 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF3Q9H094 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF3Q9H094 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF3Q9H094 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF3Q9H094 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF3Q9H094 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NBPF3Q9H094 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NBPF3Q9H094 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NBPF3Q9H094 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms