Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1EQ9GZS1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms