Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D4

ZNF518B, Zinc finger protein 518B, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF518BQ9C0D4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF518BQ9C0D4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF518BQ9C0D4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF518BQ9C0D4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF518BQ9C0D4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF518BQ9C0D4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF518BQ9C0D4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF518BQ9C0D4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF518BQ9C0D4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF518BQ9C0D4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF518BQ9C0D4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF518BQ9C0D4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF518BQ9C0D4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF518BQ9C0D4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF518BQ9C0D4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF518BQ9C0D4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF518BQ9C0D4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF518BQ9C0D4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF518BQ9C0D4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF518BQ9C0D4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF518BQ9C0D4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF518BQ9C0D4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF518BQ9C0D4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF518BQ9C0D4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF518BQ9C0D4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF518BQ9C0D4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF518BQ9C0D4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF518BQ9C0D4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF518BQ9C0D4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF518BQ9C0D4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF518BQ9C0D4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF518BQ9C0D4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF518BQ9C0D4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF518BQ9C0D4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF518BQ9C0D4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF518BQ9C0D4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF518BQ9C0D4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF518BQ9C0D4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF518BQ9C0D4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF518BQ9C0D4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF518BQ9C0D4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF518BQ9C0D4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNF518BQ9C0D4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF518BQ9C0D4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNF518BQ9C0D4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF518BQ9C0D4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms