Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
EDEM3Q9BZQ6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms