Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL6

PRKD2, Serine/threonine-protein kinase D2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD2Q9BZL6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKD2Q9BZL6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKD2Q9BZL6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKD2Q9BZL6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKD2Q9BZL6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKD2Q9BZL6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKD2Q9BZL6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKD2Q9BZL6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKD2Q9BZL6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKD2Q9BZL6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKD2Q9BZL6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKD2Q9BZL6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKD2Q9BZL6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKD2Q9BZL6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKD2Q9BZL6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms