Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
UPF3BQ9BZI7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPF3BQ9BZI7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPF3BQ9BZI7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
UPF3BQ9BZI7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPF3BQ9BZI7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
UPF3BQ9BZI7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPF3BQ9BZI7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPF3BQ9BZI7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPF3BQ9BZI7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPF3BQ9BZI7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPF3BQ9BZI7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms