Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE9

CDHR2, Cadherin-related family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR2Q9BYE9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDHR2Q9BYE9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDHR2Q9BYE9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDHR2Q9BYE9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDHR2Q9BYE9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDHR2Q9BYE9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDHR2Q9BYE9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDHR2Q9BYE9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CDHR2Q9BYE9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms