Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms