Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM208Q9BTX3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM208Q9BTX3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM208Q9BTX3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM208Q9BTX3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM208Q9BTX3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM208Q9BTX3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM208Q9BTX3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM208Q9BTX3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM208Q9BTX3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM208Q9BTX3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM208Q9BTX3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM208Q9BTX3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM208Q9BTX3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM208Q9BTX3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM208Q9BTX3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM208Q9BTX3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM208Q9BTX3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM208Q9BTX3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM208Q9BTX3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM208Q9BTX3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM208Q9BTX3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM208Q9BTX3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM208Q9BTX3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM208Q9BTX3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM208Q9BTX3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM208Q9BTX3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM208Q9BTX3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM208Q9BTX3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM208Q9BTX3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM208Q9BTX3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM208Q9BTX3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM208Q9BTX3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM208Q9BTX3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM208Q9BTX3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM208Q9BTX3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM208Q9BTX3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM208Q9BTX3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms