Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms