Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SGIP1Q9BQI5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms