Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREX2Q9BQ50 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms