Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms