Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED1Q99966 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms