Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms