Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTRQ99707 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MTRQ99707 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTRQ99707 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTRQ99707 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTRQ99707 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTRQ99707 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MTRQ99707 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTRQ99707 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTRQ99707 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTRQ99707 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTRQ99707 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTRQ99707 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTRQ99707 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTRQ99707 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTRQ99707 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTRQ99707 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTRQ99707 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTRQ99707 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTRQ99707 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTRQ99707 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTRQ99707 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTRQ99707 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTRQ99707 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTRQ99707 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MTRQ99707 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MTRQ99707 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTRQ99707 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTRQ99707 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTRQ99707 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTRQ99707 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTRQ99707 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTRQ99707 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTRQ99707 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTRQ99707 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTRQ99707 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTRQ99707 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTRQ99707 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTRQ99707 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTRQ99707 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTRQ99707 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTRQ99707 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTRQ99707 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTRQ99707 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTRQ99707 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTRQ99707 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTRQ99707 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTRQ99707 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MTRQ99707 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MTRQ99707 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MTRQ99707 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTRQ99707 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTRQ99707 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTRQ99707 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTRQ99707 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTRQ99707 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTRQ99707 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTRQ99707 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTRQ99707 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTRQ99707 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTRQ99707 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTRQ99707 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTRQ99707 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTRQ99707 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTRQ99707 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTRQ99707 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTRQ99707 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MTRQ99707 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTRQ99707 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTRQ99707 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTRQ99707 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTRQ99707 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTRQ99707 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTRQ99707 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTRQ99707 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTRQ99707 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTRQ99707 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTRQ99707 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTRQ99707 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTRQ99707 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTRQ99707 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTRQ99707 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTRQ99707 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTRQ99707 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTRQ99707 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTRQ99707 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTRQ99707 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTRQ99707 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTRQ99707 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTRQ99707 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTRQ99707 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MTRQ99707 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTRQ99707 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTRQ99707 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTRQ99707 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTRQ99707 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MTRQ99707 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTRQ99707 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTRQ99707 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTRQ99707 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms