Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHP1Q99653 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms