Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PIK3R4Q99570 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms