Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms