Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CICQ96RK0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms