Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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ODF3Q96PU9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF3Q96PU9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ODF3Q96PU9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3Q96PU9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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