Protein–RNA interactions for Protein: Q96PT4

DUX3, Putative double homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX3Q96PT4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX3Q96PT4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms