Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSNARE1Q96NA8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms