Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC7Q96M83 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms