Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM227BQ96M60 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms