Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms