Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SENP8Q96LD8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms