Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALPK3Q96L96 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALPK3Q96L96 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALPK3Q96L96 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALPK3Q96L96 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ALPK3Q96L96 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALPK3Q96L96 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALPK3Q96L96 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALPK3Q96L96 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALPK3Q96L96 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ALPK3Q96L96 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ALPK3Q96L96 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALPK3Q96L96 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALPK3Q96L96 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALPK3Q96L96 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALPK3Q96L96 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALPK3Q96L96 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ALPK3Q96L96 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALPK3Q96L96 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALPK3Q96L96 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ALPK3Q96L96 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ALPK3Q96L96 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms